Historiador, escritor y teólogo jesuita, nace en el puerto de Veracruz en 1729.

Decide dedicarse a la vida religiosa por lo que en 1747 ingresa a la Compañía de Jesús. Es un alumno muy destacado, muestra gran capacidad para los idiomas y es sobresaliente en todas las materias.

Fue maestro de gramática y también se dedica al estudio de las lenguas prehispánicas. Cuando en 1767 la orden jesuita es expulsada de México, Francisco Alegre tiene que emigrar a Italia, donde permanece hasta su muerte.

Escribió la obra Historia de la Compañía de Jesús, que es el documento más importante acerca de las misiones evangelizadoras jesuitas en México.